Program Studi Teknik Pertambangan merupakan salah satu Program Studi terpopuler khususnya di taanh papua karena melihat kondisi sumber daya alam di papua yang begitu berlimpah, maka dibutuhkan manusia untuk dapat mengolahnya. Sehubungan dengan kemajuan ilmu pengetahuan dan Teknologi di bidang pertambangan dan energi, maka di perlukan Sumber Daya Manusia yang berpotensi dibidangnya, sehingga sumber daya alam yang ada, dapat diolah dan dimanfaatkan sebaik mungkin tanpa meruksa lingkungan sekitarnya. Untuk menjawab tantangan tersebut USTJ telah membuka Program Studi Teknik Pertambangan sejak Tahun 1995 dengan jenjang program studi Strata Satu (S1) dan telah Terakreditasi "BAIK SEKALI" berdasarkan Keputusan LAM-Teknik No. 0205/Sk/AM Teknik/AS/XII/2022